Жаратылыстану факультетінің ғылыми-зерттеу жұмыстары төмендегі бағыттар бойынша жүргізілуде:
«Қазіргі заманғы ҚР-ның экологиялық мәселелері және оны шешу жолдары». Жетекшісі: академик О.С. Балабеков.
«Жануарлар биологиясының өзекті мәселелері». Жетекшісі: доцент Х.Сартаева .
«Оңтүстік Қазақстан облысында ауыз судың экологиялық мәселелері және шешудің жолдарын зерттеу. Су ресурстарын тазарту мәселелерін зерттеу». Жетекшісі: доцент Ө.А. Алтаев, Г.Б. Алпамысова.
«Өсімдіктердің биологиялық алуан түрлілігін сақтау». Жетекшісі: доцент Н.М. Байсеитова.
«Биология пәнін оқытудың белсенді түрлері мен әдістері». Жетекшісі: доцент А.Е. Айтбаева, аға оқытушы Г.С. Халыкова.
«Суда ерігіш полимерлердің каллоидты-химиялық қасиеттері және оларды қолданудың ғылыми негіздемесін жасау» тақырыбында ғылыми-зерттеу жұмысын жүргізу. Ғылыми жетекшісі: Мәдібекова Ғ.М.
«Ауылшаруашылық дақылдарын егіу алдындағы өңдеу технологиясы (Предпосевной обработки семян сельхоз культур)». Ғылыми жетекшісі: т.ғ.д., профессор Аширов А.М.
«Химияны оқытудың инновациялық әдістемесі». Ғылыми жетекшісі: х.ғ.к., доцент Шағраева Б.
«Суда ерігіш полимердің БАЗ-дармен композициалды негізінде жаңа материалдар алу». Ғылыми жетекшісі: Мәдібекова Ғ.М.